學生姓名:
余宗翰
指導教授:
張正明
學期:
105下
摘 要:
常見經濟性水產品是人類食品供應的重要貢獻者。然而，隨著水產品行業的快速全球化，水產品市場日趨無序。因此，一個準確方便的方法為確定常見經濟性水產品是必要的。 DNA barcoding ，構成短的線粒體細胞色素 C 氧化酶 I 亞基 (mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I ， COI) 序列片段分析，已被廣泛應用於物種鑑定。要使用 DNA 條形碼辨別常見經濟性水 生物種，作者收集了常見 534 COI 條碼序列 ，由常見的 66 物種構成， 39種魚類， 9 種甲殼類動物和 18 種軟體動物。基於 the Kimura 2 - parameter (K2P) model 得到種內的遺傳距離，魚少於 1.37% ， 甲殼類動物為 7.32% 和軟體動物為 3.40% ，而屬內的距離範圍魚從 3.91% - 13.82% ，甲殼類動物從 14.99% - 16.17% 和軟體動物從 14.82% - 16.36% ，說明該段序列能區分不同物種。根據 K2P 距離產生 neighbor - joining (NJ) tree ，和所有的物種可以在 tree 上明確地識別，幾個分支呈現 100% 的自展值 (bootstrap) ，近緣物種聚集在一起，顯示高的可信度。使用 DNA barcoding 在 66 物種被成功檢測出 8 種替代品物種。另一份研究，作者也在港口實際進行短體羽鰓鮐(Rastrelliger brachysoma) 身份驗證，成功檢測出細尾副葉鯵 (Alepes apercna)替代品物種。對超市跟網路市場 52 項鱈產品進行 DNA barcoding 鑑定，並對鱈魚進行三個嚴格定義： (1) 鱈魚是鱈形目; (2) 鱈魚是鱈屬; (3) 鱈魚沒有指定具體品種，因為限定 (“大西洋”，“太平洋”或“格陵蘭島”) ，應各別指出大西洋鱈、太平洋鱈、格陵蘭鱈。結果用嚴格三項定義，有 100% 的高貼錯標籤率。因此，通過 DNA barcoding 可避免商業詐欺，並對常見的水產品貿易行業可以有效地監控並管理。
碩專班專題討論20170325余宗翰-題目摘要大綱.pdf