以 DNA 條碼對孟加拉、雪梨及台灣海峽的魚類做魚種鑑定探討

學生姓名: 謝卓廷
指導教授: 黃登福
學期: 109上
摘　　要: DNA條碼 (DNA barcoding) 是一種利用基因組內的 DNA 片段來鑑定生物物種的技術。動物物種的鑑定採用粒8體細胞色素氧化酶次單元 (cytochrome c oxidase I, COI) 作為通用DNA條碼序列。孟加拉國的小型魚類 small indigenous fish species (SIS) 魚類物種非常多元，但時常有過度捕撈的情況，為了保護現存的魚類生物多樣性，乃研究將粒線體細胞色素氧化酶次單元 (COI) 序列做物種鑑定的方法，為孟加拉國的 55 個屬，24 個科和 7 種魚類的 81 個SIS物種生成了條碼，此外還證實了有7條 SIS 魚類的新記錄，將新生成的DNA條碼與 BOLD 上的數據一起進行分析。另外，加工後的海鮮產品不易根據外觀進行識別，使低廉的魚種可以冒充價位較高的魚種，經以 DNA 條碼物種調查澳大利亞雪梨零售商使用的魚產品名稱的準確性，發現 40%魚名不符合澳大利亞魚類名稱標示 The Australian Fish Names Standard (AFNS) 。儘管缺乏標準化，DNA條碼數據仍確認了大部分樣本的識別，並對錯誤識別的樣本進行討論。其次，台灣海峽漁業資源非常豐富，是中國沿海熱門的漁場之一，但隨著過度捕撈和棲息地破壞等等對台灣海峽魚類群落的生物多樣性造成重大的影響，於是將粒線體細胞色素氧化酶次單元 (COI) 序列做物種鑑定，從 85個屬、39 個科和 11 種魚類中獲得了總共 284 個線粒體 COI 條碼序列，並使用了 Kimura-2-P (K2P) 參數模型來計算本研究中所用魚類的物種內部和物種之間的遺傳距離，並透過 neighbor-joining (NJ) 的方法建立演化樹。