民國46年設立本學系前身水產教育科

民國48年配合政策更名為水產製造科

民國53年改制為水產製造學系，並成立夜間部

民國64年成立水產製造研究所（碩士班）

民國72年更名為水產食品科學系暨研究所

民國74年增設博士班

民國80年大學部增為雙班

民國87年更名為食品科學系

民國88年招收碩士在職進修專班

民國93年大學部分食品科學組與生物科技組招生

民國110年大學部不分組招生

民國112年進修學士班停招

民國44-53年海專後期之水產分析課程

民國54-65年海洋學院時期之水產加工製造實習

民國114年學生校外參訪