益生菌功能性基因標鑑定的多體學研究: 基因體學、比較基因體學及蛋白體學
學生姓名:
陳欣蘭
指導教授:
陳詠宗
學 期:
114上
摘 要:
本報告整合基因體學、比較基因體學與比較蛋白體學，探討多體學在益生菌功能性基因篩選與驗證中的應用與互補性。基因體學透過全基因體測序揭示益生菌潛在的功能性基因，如與抗氧化作用、耐膽鹽等相關基因，提供菌株功能的藍圖。然而，基因的存在與實際表達或發揮功能不一定一致，因此僅具潛力參考價值。比較基因體學則能透過比對不同表型菌株間的基因差異，找出與特定性狀密切相關的基因，如 sfcA 被確認與膽鹽耐受性相關，可作為快篩的潛力靶標。然而，基因功能表現受調控影響，仍需轉錄或蛋白層面的驗證。相較之下，蛋白體學直接反映菌株在不同條件下的反應，能揭示真實功能與表型間的分子連結。以 Lactiplantibacillus plantarum KM1 為例，其在 H2O2 壓力下透過調整多條代謝途徑，展現抗氧化機制。綜合而言，基因體學提供功能潛力資訊，為探索基礎；比較基因體學可定位候選基因，提升篩選效率；而蛋白體學則驗證實際的功能表現。三者互補，可由「潛力」到「候選」再到「實證」形成完整鏈結，建構出更全面的益生菌功能性基因篩選框架，為精準益生菌的開發提供依據。
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